בית ההשקעות אי.בי.אי מעלה את דמי הניהול ברוב קרנות הנאמנות בשיעור של 0.02% עד 0.15% (לרוב סביב 0.05%); מנגד איפס בית ההשקעות את עמלות הברוקראז' הנגבות דרך הפער שבין מחיר הקנייה למחיר המכירה של הקרנות. עם זאת, בקרן אחת – אי.בי.אי סיון הופחתו דמי הניהול מ-2.3% ל-1.25%. הרפורמה הזו בדמי הניהול מעלה את ממוצע דמי הניהול בקרנות של החברה. עם זאת, יש לציין כי בשנים האחרונות נרשמה שחיקה בדמי הניהול במקביל להכנסת קרנות מחקות לתעשיית הקרנות. הקרנות המחקות משווקות לציבור בדמי ניהול מאוד נמוכים ואפילו אפסיים.