יחידת רשם העמותות וחברות לתועלת הציבור פועלת לצמצום הסיכון להלבנת הון וניצול לרעה של נכסים ציבוריים. לצורך כך שלחה רשמת העמותות, עו"ד קארן שוורץ, מכתב כל אל הבנקים ובו התראה שלא לאפשר פעילות בחשבונות בנק של עמותות מחוקות. במכתב ציינה הרשמת כ-26 אלף עמותות אשר נמחקו על ידי הרשם במהלך השנים.
מחיקת עמותות אלה, משמעה, כי הן אינן מהווה עוד ישות משפטית, כך שאינן כשירות לבצע פעולות משפטיות או להיות מושאן של פעולות מעין אלו, ולנושאי המשרה או מורשי החתימה בהן אין עוד הרשאה לפעול בשם העמותה או לעשות שימוש בנכסיה, כך שגם אין להם השפעה ויכולת להשתמש בחשבון הבנק של העמותה.
רשמת העמותות הבהירה בפנייתה, כי ביצוע פעולות בחשבונות הבנק של עמותות שנמחקו, עלול להביא לסיכונים משפטיים שונים הנובעים מהלבנת הון, הברחת נכסים וריקון קופת העמותה. בנוסף, הזמינה רשמת העמותות את התאגידים הבנקאיים להפנות אל יחידת רשם העמותות גורמים המבקשים לבצע פעולות בחשבון בנק של עמותה מחוקה, לשם המשך טיפול בהתאם להוראות הדין.
לדברי הרשמת שוורץ, "בשנים האחרונות פועלת יחידת רשם העמותות וחברות לתועלת הציבור למחיקת עמותות שאינן מגישות דיווחים שנתיים לרשם העמותות, בניגוד לחוק, ובכך פוגעות באפשרות הרשם ובאפשרות הציבור לפקח עליהן. המשך פעילות כספית של עמותות אלה עלול לעתים לשרת מטרות זרות ופעילות לא חוקית. לפיכך, אנו רואים חשיבות רבה לכך שהבנקים ימנעו פעילות כספים לא מורשית זו. אינטרס ציבורי זה הוא העומד בבסיס פנייתנו אל הבנקים, ואנו בטוחים שבשל פנייה זו יפעלו הבנקים למנוע פעילות כספית לא מורשית בחשבון בנק של עמותות שנמחקו".